В Самарской области сформирована уникальная сеть различных особо охраняемых природных территорий. Ее основу составляют ООПТ федерального значения: Жигулевский государственный природный заповедник им. И.И. Спрыгина, Национальный парк «Самарская Лука», Национальный парк «Бузулукский бор»; а также ООПТ регионального значения и другие ООПТ.
Жигулевский государственный заповедник им. И.И. Спрыгина.
Заповедник расположен в Среднем Поволжье в наиболее возвышенной части Самарской Луки - Жигулевских горах - в западной части Самарской области.
Заповедник особо отличается разнообразием растительного и животного мира.
Флористическое богатство заповедника в настоящее время определяется в 1149 видов автотрофных растений.
Из 1022 видов сосудистых растений флоры заповедника признано имеющими особое научное значение 178 видов.
Большая часть территории заповедника (95 %) покрыта лесами.
В заповеднике достоверно зафиксированы встречи 229 видов птиц (около 80 % видов орнитофауны Самарской области), из которых
150 регулярно встречаются на территории и у границ заповедника
Современный состав фауны млекопитающих насчитывает 48 видов зверей, относящихся к 6 отрядам, 15 семействам и 34 родам (что составляет 63 % числа видов млекопитающих Самарской области).
Большим разнообразием отличается также фауна беспозвоночных - более 7 тысяч видов
Вместе с тем, даже на особо охраняемых природных территориях отмечаются факты процессов деградации экологических систем. Здесь значительно уменьшилась площадь сосновых лесов, практически полностью исчезли высокоствольные дубравы. Хозяйственное освоение территории Самарской Луки нанесло существенный урон растительному и животному миру.
Национальный парк «Самарская Лука»
Современные экосистемы Самарской Луки являются убежищем для большого числа вымирающих растений и животных. Во флоре Самарской Луки отмечено 1302 вида сосудистых растений, среди которых 102 вида относятся к эндемикам и 60 видов – к реликтовым растениям. Крайне редкими являются 44 вида сосудистых растений.
Степень сохранности природных территориальных комплексов на территории парка ниже, чем на территории Жигулевского заповедника, при этом видовое разнообразие национального парка богаче за счёт пойменных видов – здесь в настоящее время отмечаются 61 вид млекопитающих, 213 видов птиц (около 150 гнездящихся), 9 видов пресмыкающихся, 8 видов земноводных и около 45 видов рыб.
В результате интенсивных рубок, проводившихся до организации национального парка, структура лесных сообществ сильно изменена. В основном преобладают средневозрастные леса с доминированием од¬ной из пород: липы, дуба, осины.
Состояние древесно-кустарниковой растительности по итогам 2011 года оценивается как удовлетворительное.
По итогам 2011 года заметного снижения численности основных видов позвоночных животных не отмечено.
Национальный парк «Бузулукский Бор»
На территории Самарской и Оренбургской областей в пойме реки Самара, ее притоков рек Боровки и Колтубанки на первой и второй надпойменных террасах находится уникальный лесной массив Бузулукский бор.
Способствуя выпадению дождей и накоплению снега, благоприятствуя переводу поверхностных талых вод в грунтовые, бор сдерживает водную эрозию почв и регулирует запасы воды в бассейнах рек Боровка, Чертаклы, Муштай, Колтубань, Танеевка и другие.
В современном растительном покрове Бузулукского бора, по данным проводившихся за последние годы флористических исследований, встречается 679 видов сосудистых растений, относящихся к 353 родам, 96 семействам, 7 классам и 5 отделам. На территории бора обитают 55 видов млекопитающих, около 180 видов рептилий, 6 видов амфибий, 24 вида рыб. Из общего числа обитателей бора некоторые виды находятся под охраной и занесены в Красную книгу РФ, Оренбургской и Самарской областей.
Особо охраняемые природные территории регионального значения
Система особо охраняемых природных территорий регионального значения в Самарской области в настоящее время представлена одной, самой многочисленной категорией ООПТ - памятниками природы регионального значения (в 2011 году их имелось 214).
Доля площади ООПТ регионального значения в общей площади территории Самарской области в 2011 году достигла 0,8 %.
На 31 декабря 2011 года завершена инвентаризация и землеустройство всех существующих памятников природы, утверждены их границы, разработаны и утверждены Правительством Самарской области положения памятников природы регионального значения.